昨（19）日公布國內有4例BA.4.6個案，醫療應變組副組長羅一鈞表示，這4例BA.4.6個案都是輕症，國際報告也沒看到針對BA.4.6提到較為嚴重的研究。國際間關注的除了BA.5以外，BA.4.6與BA.2.75全數屬於輕症化。是否造成雙主流，BA.4.6雖傳播力比BA.5高，但BA.4.6在英美的佔比偏低，能不能超過BA.5還要再觀察。過去BA.2.75曾傳出會蓋過BA.5，但全球主流株還是BA.2近期還有2到3個月的時間會居於主流。未來可能演化出更強的變異株，必須觀察是否有更多變異株出現。

中央流行疫情指揮中心在今（19）日公布本土個案的基因定序。中央流行疫情指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞表示，本土BA.5在近1週內新增106例，目前BA.5佔本土個案已經達到59.2%，其餘40.8%則是檢出BA.2，顯示BA.5正慢慢蓋過BA.2。另外境外移入與本土病例，也驗出少量在歐美流行的BA.4.6變異株。

這波本土疫情爆發以來，已累積31例幼童重症腦炎個案，造成11名小朋友死亡，比率高於許多國家，三軍總醫院找到致病關鍵，那就是變異株亞型BA.2.3.7的突變位點K97E，研究證實，該變位點將干擾病童免疫系統，誘發「免疫風暴」， 惡化成急性腦炎或全身系統性的發炎疾病。

中央流行疫情指揮中心今（12）日公布國內新增234例Omicron亞型變異株確定病例，本土病例為88例BA.5、86例BA.2，境外移入為5例BA.4、50例BA.5、1例BA.2.75、4例BA.2。其中以北部有45例為最多，中部34例、南部8例、東部1例。其中兒童與青少年，共有15人。

中央流行疫情指揮中心今（8）日表示，為提供國內具高重症及死亡風險之免疫低下族群更完善的保護，以降低疫情對國內醫療量能之衝擊，日前衛福部疾管署已採購1萬劑Evusheld單株抗體，第1批1,728劑單株抗體已於9月6日晚間到達，並於今日配送。

中央流行疫情指揮中心在今（7）日宣布新增26例死亡，最年輕的個案有2名40多歲男性，其中1人為重複感染。這位重複感染個案有風濕免疫疾病，主要是系統性血管炎病史，接種2劑疫苗，在5月中與7月底確診過，且在2次確診收治住院後，併發十二指腸出血、沒菌血症、敗血性休克，經積極治療後仍於8月28日過世。

中央流行疫情指揮中心在5日表示，在衛生福利部傳染病防治諮詢會預防接種組（ACIP）專家會議後，專家就莫德納次世代雙價疫苗追加劑接種順序、接種間隔進行討論。經評估疫苗臨床試驗安全性及有效性結果、疫苗核准情形、國內外疫情風險，並參酌各國現行疫苗接種政策。

中央流行疫情指揮中心近日購買莫德納之次世代疫苗，因該疫苗為針對BA.1的疫苗而非BA.5而引發爭議：指揮官王必勝罕見地在週六（9／3）舉行記者會強調，即使是原始株加BA.1的疫苗，對於防範疫情大雨，仍然是把「好傘」；但媒體人趙少康批評指揮中心決策不佳，批評疫苗是「破傘擋不了大雨」。