新冠疫情及季節性流感來勢洶洶，新冠確定病例每日仍新增3萬餘例，加上今年類流感門急診就診病例百分比有上升趨勢，呼籲民眾應儘速完成疫苗接種，50歲以上民眾自11月1日起開放接種公費流感疫苗，新北市接種流感疫苗提供「合約院所」、「社區設站」、「新北市疫苗預約系統預約接種」多元管道便利民眾接種，且自今日（10月26日）起開放第10期疫苗接種預約，民眾可多多利用，提升保護力。

中央流行疫情指揮中心在今（26）日宣布新增40,261例本土個案，56例境外移入，52例死亡個案。指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞表示，今日新增年輕死亡個案為2名30多歲女性，皆打過疫苗，但本身患慢性疾病，染疫後不幸病情惡化過世。

中央流行疫情指揮中心今（26）日公布新增1例接種莫德納次世代疫苗後的死亡個案，同時新增3例MIS-C個案。醫療應變組副組長羅一鈞表示，今日新增3例MIS-C；首先是年紀最小的1歲男童，未打疫苗，無慢性病史；在9月14日確診，10月14日有發燒等症狀，懷疑有MIS-C住院，檢查出心包膜積水、腹水，給予免疫球蛋白等藥物治療後，病況好轉，已經在10月25日出院。

近期廣受討論的是BA.5雙價疫苗有望抵台。中央流行疫情指揮中心在今（25）日透露BA.5雙價次世代疫苗。指揮官王必勝曾透露，莫德納與BNT的BA.5雙價疫苗資料已繳交完畢。指揮中心發言人莊人祥今（25）日表示，BA.5雙價疫苗最快在明（26）日進行EUA審查，審查後必須安排ACIP討論接種建議。接下來需要大約2週進行安排抵台時間等。至於進貨的大概時間，莊人祥僅稱「盡量安排」。

中央流行疫情指揮中心說明今（25）日新增42例死亡個案，無較年輕的死亡個案。然特殊重症中，有1位9歲男童同時發生3個疾病！指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞表示，今日無年紀較輕的死亡個案。然特殊重症中有1例9歲男童，曾接種2劑疫苗，無慢性病史。個案在10月13日出現發燒、喉嚨痛、咳嗽等症狀，但到診所做快篩是陰姓，10月15日突發呼吸困難、嘴唇與四肢發紫，送急診就醫。

有關接種高端疫苗者在赴日前須自費做PCR之爭議，部分輿論認為高端公司應對此提出協助方案。在24日，高端公司發布新聞稿，宣布從28日起將提供免費PCR。高端表示，依日本現行防疫規定，入境者須打滿3劑列入WHO緊急使用清單（EUL）之疫苗或檢附PCR陰性證明。除中央疫情指揮中心宣佈補打疫苗措施外，該公司考量社會責任、企業形象及股東權益，並參考律師提供之法律意見書與各界意見反饋，評估可在財務負擔允許及合理範圍內，協助政府一起解決部分國人赴日的不便，將於年底前免費提供接種高端新冠疫苗之民眾赴日前PCR檢測服務。

中央流行疫情指揮中心在今（25）日宣布新增39,148例本土個案，55例境外移入，42例死亡個案，指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞表示，今日新增1名特殊重症，個案是個9歲男童，接種過2劑疫苗，本身沒有慢性疾病，染疫住院後新診斷出氣喘。

秋冬是呼吸道病毒流行期，近期通報顯示呼吸道融合病毒、流感、肺炎鏈球菌開始傳染，如加上新冠病毒，這「3病1菌」的流行，將使得國內醫療量能出現隱憂。疾管署副署長、指揮中心發言人莊人祥表示，從實驗室通報系統的趨勢來看，社區主要流行病毒，第1名是新冠病毒，第2多的是流感病毒，共通報109人；第3名是肺炎鏈球菌；最後是副流感病毒原本上升又開始下降；不過呼吸道融合病毒（RSV）上升速度最快。