衛生福利部中央健康保險署公布106年度領取健保費用4億元以上、150家醫院財報與醫療服務申報報告，林口長庚紀念醫院蟬聯全台最賺錢的醫院，整體結餘金額近80億元，不過，醫務結餘部分僅1.85億元，非醫務結餘金額，如股利股票所得、停車場、美食街等，盈餘高達77.8億元。
健保署副署長蔡淑鈴指出，這次所公布的醫院財報對象為領取健保費用4億元以上的醫院，共計150家醫院，其中包括醫學中心19家，區域醫院79家，地區醫院52家。依照「全民健康保險醫事服務機構提報財務報告辦法」，107年醫院財務報告公開門檻為領取健保費用2億元以上的醫療院所，屆時民眾就可了解不少知名診所的財務狀況。
106年整體結餘金額排行前10名，長庚體系醫院占了4名，分別為林口長庚第1、高雄長庚第2、桃園長庚第5、基隆長庚第6，但皆是非醫務結餘部分撐起一片天，基隆長庚在醫藥本業部分還賠了3.87億元，但非醫務結餘卻高達22.83億元。對此，長庚醫療體系行政中心副主任蘇輝成表示，106年整體股市表現不錯，長庚體系共分205億元股利，比105年多出快50億元，幾家體系醫院的非醫務結餘金額貢獻良多。
至於醫務結餘金額（醫療本業）最多的為中國醫藥大學附設醫院，整體結餘金額23.93億元，整體排行名列第4，但醫療本業盈餘卻有21.42億元，非醫務結餘金額則有2.51億元。至於台大醫院的表現也很出色，在整體結餘金額排行中，名列第3，總盈餘23.97億元，醫務結餘金額15.23億元，非醫療部分則有8.95億元。
另外，健保署也公布106年虧損最多的前5家醫院，分別為嘉義長庚（-5.22億元）、敏盛綜合醫院（-2.01億元）、義大癌治療醫院（-1.21億元）、麻豆新樓醫院（-0.9億元）、怡仁醫院（-0.63億元）等。
