中南部豪雨成災，不少罹患慢性疾病的災民面臨無藥可用的窘境，南投地區有6名結核病患無法順利服藥，所幸南投縣政府衛生局以人力接駁及直升機空投等方式，緊急送藥至災區，順利讓4名結核病個案及2名潛伏結核感染病患服用藥物，不致藥物中斷。
另外，部分災區則傳出洗腎患者延誤洗腎的情況，亟需醫療機構。台灣腎臟透析學會調查發現，中南部受災縣市透析院所運作狀況，大多數透析院所都還能持續運作，但部分病患因交通中斷，而無法及時到院洗腎。
為此，台灣腎臟醫學會呼籲，請各縣市災難救援中心優先後送洗腎患者至安全地區，以及優先供水給透析院所，以搶救生命遭受重大威脅的洗腎病患。
在結核病防治方面，疾管局強調，結核病藥物中斷若達到兩個星期，就會造成治療失敗。因此，在天然災害之前，就提醒各縣市衛生局先行備藥，並於災後立即清查有無送藥中斷情形。
為了協助災區結核病患，以及散居各收容中心的在案結核病患都能獲得連續性及整體性照顧，疾管局除了確保病患用藥無中斷之虞外，都治計畫關懷員也持續前往災民居住地，給予心理支持，避免受災地區爆發結核病流行。
在南投災區就有6名結核病患，4名確定感染者分別住於水里鄉玉峰村、信義鄉人和及東埔村。2人為潛伏結核感染病患，住在信義鄉及東埔村。此6人因道路受阻，無法返回居住處接受送藥服務，面臨斷藥危機。
疾管局接獲南投縣結核病都治關懷員通報後，立即展開行動，利用人力接駁，及直升機空投等方式，讓病患順利服用藥物。
另外，考量天然災害後的意外創傷事件發生，疾管局已利用空運方式運送破傷風類毒素及消毒藥材、藥水至受災地區調度使用，並全力協助地方衛生單位進行環境消毒及各項災後防疫工作，並加強受災地區傳染病監視，降低爆發傳染病流行之風險。
截至目前為止，疾管局已調度支援11部消毒車、23萬份消毒藥品及破傷風類疫苗2萬人份至受災地區，並投入超過80名人力進行災後防疫工作，目前已消毒及宣導戶數計3萬8千戶。
