一位女性患者因為2、3年前曾做過水雷射治療牙周病，沒想到2年後竟然復發，經過醫師看診後，發現全口牙只剩上排10顆、下排6顆，後牙區可說損失慘重，仔細檢查後，更發現其中4、5顆的牙床骨幾已被破壞殆盡，狀況比起2年前更糟糕，能保留的健康牙齒所剩無幾。
牙周病的治療必須徹底清除牙菌斑，才能避免牙周病持續擴散，雷射治療主要作用在於利用雷射的高能力將牙周病的細菌消除。中華民國牙周病醫學會醫師暨法國(Lokki)雷射牙周病認證醫師陳孟傑表示，單純利用水雷射治療牙周病，對於頑強的牙菌斑難以完整清除，因為牙齒表面還是會持續黏附牙菌斑，因此必須配合石英震盪器特殊洗牙過程，才能有效去除附著在牙齒表面的牙結石，相較於傳統牙周治療，雷射治療在正統牙科領域中，是被認定屬於輔助性治療。
雷射治療的低疼痛、復原快的優點，的確讓治療牙周病減少必須經過開刀翻瓣的較大痛楚，更是牙科醫療上的一大進展，不過，雷射治療原理主要是藉由熱能殺菌，瞬間就能達到1000多度的高溫，因此，雖然雷射問世能大大減輕牙周病患治療的不適，卻也因為高熱能的瞬間釋放，如果操作不當、使用方式有誤，很可能在操作過程因為過熱而受傷，像是骨質快速流失、牙肉軟組織裂開，嚴重不慎傷及神經等後遺症，操作的醫師必須相當小心，除了對使用儀器相當熟練，也必須有豐富經驗，才能確保雷射過程的安全無虞。
雷射治療牙周並非唯一的方式，亦非萬能，但是可提供牙醫師另外一項輔助牙周治療的選擇，適用於害怕疼痛、慢性病患。中華民國牙周病醫學會醫師陳孟傑表示，若屬於中重度牙周病患，可以由幾乎無疼痛的雷射刀取代傳統手術刀翻開牙肉瓣，達到殺菌、止血的效果，不需拆線，復原期短，使用牙周激光雷射、搭配特殊藥劑，不僅能抑菌，也能保住輕微鬆動的牙齒，避免開刀中牙根不穩脫落。
牙周雷射治療常面臨健康牙齒必須去或留的狀況，事實上，有些患者在洗牙時，搖晃的牙齒可能已經搖搖欲墜，剩餘的牙床骨不多，咀嚼食物的受力不佳，已經無法回到健康牙齒的受力狀態，必須特別小心。但坊間有些醫師信口開河，對患者保證能留下牙齒，卻造成後續感染問題擴大，消費者應多留意比較，選擇專業、經驗豐富的牙醫師，牙醫師甯秋華表示，術前必須經過牙醫師判斷，做出完整規劃設計，才能擁有充分的醫療保障。
